レベルⅢは臨床解剖を理解し、「指導医」とともに内視鏡下手術の「術者」を安全に行う技量を有することとする。

認定条件：各診療科の基準による（下記付記参照、体内結紮法での実技試験の要否は診療科による）

各診療科基準の中に実技試験(体内結紮法)が含まれる場合、レベル IIの実技試験と同内容だが、2分以内に3回結紮することが合格基準となる。

レベルIIIの認定を取得するためには、レベルIII認定申請書をセンター問い合わせ先へ提出する。
センターで申請内容を確認し、各診療科の基準を満たしている場合、レベルIII認定証が交付される。
実技試験は年間を通じて定期的に開催される（トップページの院内技術認定試験日程を参照）。

H27年4月1日より、腹腔鏡・胸腔鏡手術を行う術者は手術開始時（タイムアウト時）
レベルIIIないしは指導医の資格を有していることを確認する。
資格のないものは手術を執刀できない。