研究概要

オルガネラは状況に応じて様々な形態をとることが知られている。しかし、このオルガネラの形態変化が各オルガネラを情報プラットフォームとして利用している細胞内シグナル伝達系やオルガネラ・ゾーン間の相互作用などにどのような影響を与えているのかは、実験技術が不足しているために十分理解されていない。そこで我々はオルガネラの形態を可逆的かつ短時間で変化させることができる複数の手法を開発し、それらを用いてオルガネラの形態自体がコードしている情報の解読を試みる。

代表的な原著論文

1. Miyamoto T, Tanikawa C, Yodsurang V, Zhang YZ, Imoto S, Yamaguchi R, Miyano S, Nakagawa H, Matsuda K. Identification of a p53-repressed gene module in breast cancer cells. Oncotarget. 2017 Jul 26;8(34):55821-55836.
2. Miyamoto T, Lo PHY, Saichi N, Ueda K, Hirata M, Tanikawa C, Matsuda K. Argininosuccinate synthase 1 is an intrinsic Akt repressor transactivated by p53. Sci Adv. 2017 May 19;3(5):e1603204.
3. Miyamoto T*, Rho E, Sample V, Akano H, Magari M, Ueno T, Gorshkov K, Chen M, Tokumitsu H, Zhang J*, Inoue T*. Compartmentalized AMPK signaling illuminated by genetically encoded molecular sensors and actuators. Cell Rep. 2015 Apr28;11(4):657-70.
4. Miyamoto T, DeRose R, Suarez A, Ueno T, Chen M, Sun TP, Wolfgang MJ, Mukherjee C, Meyers DJ, Inoue T. Rapid and orthogonal logic gating with a gibberellin-induced dimerization system. Nat Chem Biol. 2012 Mar 25;8(5):465-70.
5. Miyamoto T, Oshiro N, Yoshino K, Nakashima A, Eguchi S, Takahashi M, Ono Y, Kikkawa U, Yonezawa K. AMP-activated protein kinase phosphorylates Golgi-specific brefeldin A resistance factor 1 at Thr1337 to induce disassembly of Golgi apparatus. J Biol Chem. 2008 Feb 15;283(7):4430-8.

総説

1. Miyamoto T*, Rho E, Kim A, Inoue T*. Cellular Application of Genetically Encoded Sensors and Impeders of AMPK. Methods Mol Biol. 2018. 1732:255-272.
2. Miyamoto T, Rho E, Inoue T. Deconvoluting AMPK dynamics. Oncotarget. 2015 Oct 13;6(31):30431-2.
3. DeRose R, Miyamoto T, Inoue T. Manipulating signaling at will: chemically-inducible dimerization (CID) techniques resolve problems in cell biology. Pflugers Arch. 2013 Mar;465(3):409-17.
4. Miyamoto T, Razavi S, DeRose R, Inoue T. Synthesizing biomolecule-based Boolean logic gates. ACS Synth Biol. 2013 Feb 15;2(2):72-82.
5. 宮本崇史、井上尊生　生細胞におけるブール代数を用いた論理ゲートの構築ライフサイエンス新着論文レビュー、2012. DOI: 10.7875/first.author.2012.039.