メンバー

藤田 恭平(特任助教)

Kyohei FUJITA

研究内容

これまで、多色イメージングによる細胞系譜追跡とscRNA-seq解析を組み合わせた組織幹細胞の同定に取り組んできました。今後は神経科学の分野に足を踏み入れ、scRNA-seqの技術にDNA-barcodingと2光子イメージングやオプトジェネティクスを融合させ、個々の神経細胞の機能的特徴情報から学習行動に関係する回路メカニズムの動態を明らかにしていきたいです。


[実験技術]

・細胞培養 (Primary culture/Cell line/Organoid [舌上皮 (味蕾)・食道上皮・小腸上皮])

・多色イメージング (Rainbowマウス/Immunohistochemistry/Immunocytochemistry)

・Molecular biology一般

・ChIP assay

・FACS/Cell sorting (SONY SH800S/BD FACS Aria III)

・シングルセル解析 (scRNA-seq/scRT-qPCR) [舌上皮・食道上皮・小腸上皮・大網・心臓・Organoid]


[連絡先]


[researchmap]



略歴

[職歴]

2022年4月 – 現職

2018年3月 – 2022年3月 JST CREST研究員「臓器・組織内未知細胞の命運・機能の1細胞オミクス同時計測」

2020年11月 – 2022年3月 国立循環器病研究センター研究所病態代謝部

2018年3月 – 2020年11月 関西医科大学医学部実験病理学講座 (上野博夫教授)

2016年4月 – 2018年2月 大阪大学大学院理学研究科生物科学専攻 特任研究員

2013年4月 – 2015年3月 日本学術振興会特別研究員(DC2)


[学歴]

2012年4月 – 2016年3月 大阪大学大学院理学研究科生物科学専攻博士後期課程

系統進化学研究室/学際グループ: 常木和日子 教授/伊藤一男 講師

2009年4月 – 2011年3月 大阪大学大学院理学研究科生物科学専攻博士前期課程

系統進化学研究室: 常木和日子 教授/伊藤一男 講師

2005年4月 – 2009年3月 兵庫県立大学理学部生命科学科

生体情報学I講座: 八田公平 教授


原著論文

[英文]

•    Cellular basis of omentum activation and expansion revealed by single-cell RNA sequencing using a parabiosis model

Kazuhiko Ishigaki, Keiki Kumano, Kyohei Fujita, Hiroo Ueno

Scientific Reports, 11, 13958, 2021, DOI: 10.1038/s41598-021-93330-5


•    Mouse embryonic dorsal root ganglia contain pluripotent stem cells that show features similar to embryonic stem cells and induced pluripotent stem cells

Ryuhei Ogawa, Kyohei Fujita, Kazuo Ito

Biology Open, 6, 602-618, 2017, DOI: 10.1242/bio.021758


•    CHD7, Oct3/4, Sox2, and Nanog control FoxD3 expression during mouse neural crest-derived stem cell formation

Kyohei Fujita, Ryuhei Ogawa, Syunsaku Kawawaki, Kazuo Ito

The FEBS Journal, 283, 3791-3806, 2016, DOI: 10.1111/febs.13843


•    Roles of chromatin remodelers in maintenance of multipotency of mouse trunk neural crest cells in the formation mechanisms of neural crest-derived stem cells

Kyohei Fujita, Ryuhei Ogawa, Syunsaku Kawawaki, Kazuo Ito

Mechanisms of Development, 133, 126-145, 2014, DOI: 10.1016/j.mod.2014.05.001


•    Interaction between NF-κB signaling and Notch signaling in gliogenesis of mouse mesencephalic neural crest cells

Kyohei Fujita, Saki Yasui, Takeshi Shinohara, Kazuo Ito

Mechanisms of Development, 128, 496-509, 2011, DOI: 10.1016/j.mod.2011.09.003


•    In vitro analysis of mouse mesencephalic neural crest development

Kazuo Ito, Kyohei Fujita

Current Protocols in Neuroscience, 56, Chapter 3:Unit 3.23, 2011, DOI: 10.1002/0471142301.ns0323s56


[和文]

•    成体のゼブラフィッシュとメダカにおける呼吸・摂食運動における頭部骨格系の運動機序の生体観察、および歯の立体構造のX線マイクロCTによる高解像度解析

藤田恭平, 中山創平, 山本珠美, Moly Pricila Khan, 上杉健太郎, 磯田恵里佳, 伊藤真理子, 田島一剛, 原真弓, 松下淑恵, 山崎権彦, 八田公平

平成20・21年度SPring-8重点メディカルバイオ領域課題成果報告書, 7-10, 2010


•    屈折コンストラストX線マイクロCT解折による脊椎動物初期胚の脳における細胞核の観察

山本珠実, Moly Pricila Khan, 橋本琢人, 篭島 靖, 上杉健太郎, 竹内晃久, 鈴木芳生, 藤田恭平, 中山創平, 伊藤真理子, 磯田恵里佳, 田島一剛, 松下淑江, 八田公平

平成20・21年度SPring-8重点メディカルバイオ領域課題成果報告書, 4-6, 2010


•    A sleep disorder in zebrafish: analysis of a population that spawn before dawn

Mariko Itoh, Kyohei Fujita, Kohei Hatta

Reports of graduate school of material science and graduate school of life science, 19, 19-28, 2008


「国際学会発表」

•    Characterization of neural crest-derived stem cells in mouse dorsal root ganglia

Ryuhei Ogawa, Kyohei Fujita, Kazuo Ito

Finnish-Japanese joint symposium on Morphogenesis and Signaling (Helsinki, Finland), 2015年3月3日-4日


•    Roles of chromatin remodelers in maintenance of multipotency of mouse trunk neural crest cells in the formation mechanisms of neural crest-derived stem cells

Kyohei Fujita, Ryuhei Ogawa, Syunsaku Kawawaki, Kazuo Ito

Gordon Research Conference on Neural Crest & Cranial Placodes (Easton, USA), 2013年7月21日-26日


「国内学会発表」

•    多色細胞系譜追跡法を用いた歯肉接合上皮細胞のクローナリティ解析

田中慧介, 田中準一, 相澤怜, 吉田真子, 松浦徹, 藤田恭平, 田中麻友, 上野博夫, 美島健二, 山本松男

第63回秋季日本歯周病学会学術大会 (Web), 2020年10月16日-11月30日


•    マウス胚後根神経節はES細胞およびiPS細胞と同様の特徴を示す多能性幹細胞を含む

小川竜平, 藤田恭平, 伊藤一男

第40回日本分子生物学会年会 (神戸), 2017年12月6日-9日


•    マウス神経堤細胞由来幹細胞の形成・維持機構

藤田恭平, 小川竜平, 伊藤一男

第39回日本分子生物学会年会 (横浜), 2016年11月30日-12月2日


•    LIF/BMP2/FGF2によるマウス後根神経節内神経冠細胞由来多能性幹細胞の分化能維持と増殖

小川竜平, 藤田恭平, 伊藤一男

第38回日本分子生物学会年会 (神戸), 2015年12月1日-4日


•    マウス神経冠細胞由来幹細胞の形成機構

藤田恭平, 小川竜平, 伊藤一男

第38回日本分子生物学会年会 (神戸), 2015年12月1日-4日


•    The roles of chromatin remodelers in the maintenance of multipotency of mouse trunk neural crest cells in the relationship with the formation mechanisms of neural crest-derived stem cells

Kyohei Fujita, Ryuhei Ogawa, Syunsaku Kawawaki, Kazuo Ito

第46回日本発生生物学会年会 (松江), 2013年5月28日-31日


•    マウス神経冠細胞の未分化状態維持におけるクロマチンリモデラーCHD7の役割

小川竜平, 藤田恭平, 伊藤一男

日本動物学会第83回大会 (大阪), 2012年9月13日-15日


•    Roles of FGF and Notch signaling in the chondrogenic and gliogenic specification of mouse mesencephalic neural crest cells

Kyohei Fujita, Kanenobu Ijuin, Kouichi Nakanishi, Keisuke Sugiura, Kazuo Ito

第45回日本発生生物学会年会 (神戸) 2012年5月28日-31日


•    Roles of NF-κB signaling in gliogenesis of mouse mesencephalic neural crest cells

Kyohei Fujita, Kazuo Ito

第43回日本発生生物学会年会 (京都) 2010年6月20日-23日


•    Analyses of the mechanism for regulating tooth shape, number, and location using zebrafish (Danio rerio) and medaka (Oryzias latipes)

Sohei Nakayama, Tamami Yamamoto, Kyohei Fujita, Kentaro Uesugi, Akihisa Takeuchi, Yoshio Suzuki, Yasushi Kagoshima, Moly Pricila Khan, Kohei Hatta

第42回日本発生生物学会年会 (新潟) 2009年5月28日-31日


「その他」

[シンポジウムなど発表]

•    舌・食道上皮幹細胞の可視化を目的としたレポーターマウスの新規作出

吉田真子, 藤田恭平, 高野洋志, 八尾良司, 上野博夫

先端モデル動物支援プラットフォーム2019年度成果発表会 (滋賀), 2020年2月4日-5日


•    歯を形成する組織間相互作用の解析-硬骨魚類をモデルとして形態、数、配置の違いの謎に迫る-

中山創平, 山本珠美, 藤田恭平, Moly Pricila Khan, 八田公平

生命科学系GCOEネットワーク・フォーラム2009 (東京), 2009年2月14日


•    脳や神経回路はどのようにしてつくられるか? ヒトのモデルとしてのゼブラフィッシュを用いた研究の現在と未来。

伊藤真理子, 磯田恵里佳, 山本珠実, Moly Pricila Khan, 中山創平, 藤田恭平, 松下淑恵, 山崎権彦, 田島一剛, 八田公平

兵庫県立大学シンポジウムー産学共生への挑戦―はりま産学交流会産学パートナーシップ (姫路), 2008年9月22日


[イベント出展]

•    味蕾幹細胞を用いた味覚再生技術開発の可能性

Bio Japan 2018 (横浜), 2018年10月10日-12日


「受賞」

•    第39回日本分子生物学会年会 優秀ポスター賞


「所属学会」

•    日本分子生物学会

•    日本発生生物学会

•    日本味と匂学会

•    日本サイトメトリー学会

参加するのが趣味です。どこかで出会ったらよろしくお願いします。