M&Dデータ科学センターは、学長直轄の全学的組織であり、「AI・ビッグデータ研究部門」「生体多元情報研究部門」「ヘルスインテリジェンス部門」「データ科学アルゴリズム設計・解析部門」「メディカル統計数理研究部門」「データ科学ELSI研究部門」「スマートホスピタル部門」「データ科学戦略開発部門」の８部門から構成されている。