1. 伏見清秀. 院内ビッグデータ分析による病院機能高度化. じほう 2016.06

  2. 今井志乃ぶ、伏見清秀. すべてExcelでできる！経営力・診療力を高めるDPCデータ活用術. 日経BP社 2014.11 (ISBN : 978-4-8222-3191-0)

  3. 石川ベンジャミン光一、伏見清秀、松田晋哉 . 平成24年度がん研究開発費石川班DPC調査研究に基づく がん入院・外来化学療法ポートフォリオ . じほう 2014.02 (ISBN : 978-4840745581)

  4. 石川ベンジャミン光一、伏見清秀、松田晋哉、若尾文彦 . 厚生労働省平成23年度DPC調査データに基づく 地域病院ポートフォリオ . じほう 2013.07 (ISBN : 978-4840744799)

  5. 松田晋也、伏見清秀. 診療情報による医療評価 DPCデータから見る医療の質 . 東京大学出版会 2012.09 (ISBN : 978-4130604093)

  6. 藤森研司、伏見清秀. 医療の質向上に迫るDPCデータの臨床指標・病院指標への活用. じほう 2011.03 (ISBN : 978-4840742108)

  7. 西村周三、伏見清秀(分担執筆）. 医療経営白書. 日本医療企画 2010.09 (ISBN : 978-4-89041-955-5)

  8. 藤森研司、松田晋哉編、伏見清秀(分担執筆）. 明日の医療に活かすDPCデータの分析手法と活用. じほう 2010.01 (ISBN : 978-4840740647)

  9. 田近栄治、尾形裕也編著、伏見清秀（分担執筆）. 次世代型医療制度改革. ミネルヴァ書房 2009.08 (ISBN : 978-4623054251)

  10. 伏見清秀編、松田晋哉、阿南誠. DPCデータ活用ブック第２版. じほう 2008.10 (ISBN : 978-4840737371)

  11. メディカルコンソーシアムネットワークグループ編、伏見清秀（分担執筆）. DPC時代の病院経営を検証する. 日本医学出版 2008.03 (ISBN : 978-4902266252)

  12. P4P研究会編、伏見清秀（分担執筆）. P4Pのすべて〜医療の質に対する支払い方式とは. 医療タイムス社 2007.12 (ISBN : 9784900933309)

  13. 日本医療政策機構編、伏見清秀（分担執筆）. 医療白書2007年度版　医療崩壊から再生への“新しき潮流”−日本の医療を救う国民の選択. 日本医療企画 2007.07 (ISBN : 978-4-89041-769-8)

  14. 真野俊樹、伏見清秀、川井真. クリニカルコーディング. エルセビタ・ジャパン 2006.05 (ISBN : 978-4860345709)

  15. 伏見清秀編、松田晋哉、阿南誠. DPCデータ活用ブック. じほう 2006.04 (ISBN : 4-8407-3575-1)

  16. 伏見清秀、松田晋哉. 民間病院DPC導入事例集. じほう 2005.09 (ISBN : 978-4840734868)

  17. 松田晋哉編、伏見清秀（分担執筆）. DPCと病院マネジメント. じほう 2005.08 (ISBN : 978-4840734486)

  18. 松田晋哉編、伏見清秀（分担執筆）. 21世紀の医療と診断群分類−DPCの実践とその可能性. じほう 2003.09 (ISBN : 978-4840731843)

  19. 社会保険診療研究会編、伏見清秀（分担執筆）. 医師のための保険診療入門'99. じほう 1999.07 (ISBN : 9784840725804 )

  20. 伏見清秀（分担執筆）. 最新内科学大系プログレス第2巻. 中山書店 1997.12 (ISBN : 9784521409016)

  21. 伏見清秀（分担執筆）. 最新内科学大系プログレス第10巻. 中山書店 1997.11 (ISBN : 978-4-521-40891-0 )

  22. Fushimi, K.(分担執筆）. Membrane proteins: Structure, function and expression control. Karger. BaselSwitzerland 1997

  23. 伏見清秀（分担執筆）. 最新内科学大系第15巻. 中山書店 1993.10 (ISBN : 978-4521404014)